Эта замечательная женщина происходила из известного рода Бакуниных. Родилась она 19 (31) августа 1810 года в Санкт-Петербурге в семье дворянина Михаила Михайловича Бакунина, бывшего губернатором Санкт-Петербурга. Она являлась двоюродной сестрой знаменитому анархисту Михаилу Бакунину, а также внучкой Ивану Логгиновичу Голенищеву-Кутузову, внучатой племянницей М.И. Кутузову.
Сам Пирогов, а также посещавшие госпитали вице-адмирал П.С. Нахимов, генералы считали их незаменимыми помощницами. Екатерина Михайловна была примером бескорыстия, боролась с чиновничьим произволом. Она так сказала о своей главной цели: «я должна была сопротивляться всеми средствами и всем своим умением злу, которое разные чиновники, поставщики и пр. причиняли в госпиталях нашим страдальцам; и сражаться и сопротивляться этому я считала и считаю своим священным долгом». Е.М. Бакунина была последней из сестер милосердия, покинувшей по плавучему мосту оставляемый войсками Севастополь. В 1856 Крымская война была закончена и сестры из Крестовоздвиженской общины вернулись в Санкт-Петербург.
В 1860 году Е.М. Бакунина переехала в деревню, в село Козицино Новоторжского района Тверской губернии. Вдали от столичной суеты начался ее новый этап ее деятельности. Здесь, в российской глубинке, она открыла небольшую больничку на восемь коек, вела прием и оказывала медпомощь на свои деньги, сама же выплачивала содержание врачу. Поначалу крестьяне отнеслись настороженно к барской затее. Но вскоре недоверие ушло, и к концу года количество получивших помощь превысило две тысячи человек, через год удвоилось, росло и далее.
В 1877 году Россия вступила в очередную войну. На этот раз это была Русско-турецкая война. Бакунина, как одна из опытнейших организаторов госпитального дела, востребована руководством Российского общества Красного Креста. Несмотря на свой 65-летний возраст, она едет на Кавказ в качестве руководительницы медсестер временных госпиталей. Ее деятельность была еще более обширной, чем в годы Крымской войны.
В 1893 году, за год до смерти, она написала книгу “Воспоминание сестры милосердия Крестовоздвиженской общины”. Умерла Екатерина Михайловна 6 (18) декабря 1894 года в возрасте 84 лет. Похоронена в селе Прямухино Тверской губернии в фамильном склепе Бакуниных. Ее очень почитают ныне в Тверской области. Имя Екатерины Михайловны Бакуниной носит Общество православных врачей г. Тверь, Областной перинатальный центр в Твери. Ее имя занесено в Листы Памяти Золотой Книги Санкт-Петербурга. На свидетельстве написано: “За неоценимую роль в создании сестричества, ставшего примером беззаветного служения Отечеству, и образом милосердного отношения к ближнему Имя Сестры милосердия Екатерины Михайловны БАКУНИНОЙ, явившей христианский подвиг милосердия и претворившей “… обязанности сестры милосердие в духовное призвание жизни” (Н.И. Пирогов) занесено в Листы Памяти Золотой Книги Санкт-Петербурга”.
В Севастополе в честь Екатерины Михайловны Бакуниной названа улица, на которой стоит школа № 26, тоже носящая ее имя.